状況
どこでも見る、sshの接続確認の方法。これはできてた。
$ ssh -T git@github.com
Hi yo16! You've successfully authenticated, but GitHub does not provide shell access.
but〜は気にしなくていいらしい。
しかし、git pullができない！という問題。リモートリポジトリはあるよ！スペルミスもなし！（ git config remote.origin.url で何度も確認済み）
$ sudo git pull origin main
Permission denied (publickey).
fatal: Could not read from remote repository.
Please make sure you have the correct access rights
and the repository exists.
ちなみに sudo git してるのは、ローカルを更新する権限がないよ！と言われてしまうからです。＜これが今回のキモでした！！＞
結果的には恥ずかしい感じなんですが、きっとハマる人がいるので恥を晒していきますよ！
原因
ssh -T git@github.com を実行しているときに使うsshキーは、 ~/.ssh/id_rsa って、普通のユーザーの id_rsa のファイルです。ところが、 sudo git pull とかでgithubへ接続するときに使うsshキーは、 /root/.ssh/id_rsa です！
なので、 ~/.ssh/id_rsa.pub をgithubへ登録すると、 ssh -T git@github.com ではそれを使うので「正常」と言われます。でも、 sudo git pull 〜 では、 /root/.ssh/id_rsa を使うので、そんな人知らないとなるわけです。
configを使うにしても、 sudo git 〜 と入力したら、 ~/.ssh/config なんて見てないです！超時間かけて調べて試行錯誤してたのに全部無駄だったのね〜！！という話ですよ。
対策
ケースバイケースでいろいろだと思いますが、今回の私の場合は今回の端末を１人でしか使わないし、使う予定もないので、rootさん大活躍で問題なし。ということで、 /root/.ssh/id_rsa.pub をgithubに登録して終了。
gitでリモートリポジトリを使うときは、 sudo git 〜 で！
（たぶん、いや絶対、もっといい方法あるわ。知らんけど。）
雑記
linuxの経験の浅さによって、５時間ほどずっぽりとハマりました。ググってもググっても、このこと書いてる人に当たらない！みなさん賢いです！その点自分はどんだけ・・・
どうやって気づいたかと言うと、githubのヘルプ。
Should the sudo command be used with Git?
You should not be using the sudo command with Git. If you have a very good reason you must use sudo, then ensure you are using it with every command (it's probably just better to use su to get a shell as root at that point). If you generate SSH keys without sudo and then try to use a command like sudo git push, you won't be using the same keys that you generated.
引用元 Error: Permission denied (publickey)
えっと、このエラー対策の記事の一番上に書いてあるモノです。。git に sudo 使わない方がいいんじゃない？という感じでしょうかね。もし使うんなら全部にしなよ！そんなやついないと思うけど！みたいな？（どんだけ英語苦手なんだ訳）
ssh-keygen を sudo でやんないといけないのかなーくらいにぼーっと考えてやってみたら、ssh-keygen で id_rsa を上書きするよ？というメッセージが出なくて、今回の原因に気づきました。（そこ！？）
git コマンドをsudo 使わずにやりたいなー毎回めんどくさいし。でもやりかた調べてもわからない。そこは繋がらないことの本質ではないから後で考えよう。って考えが、泥沼から出られなかった大きな一因でした。ええ、結局今もわからないですが。
いやーよかった。linux経験の底の浅さが見事に露呈した問題でした。でもどうせまたすぐ忘れると思うので、自分用メモとして、また新人が陥ってたら優しく先輩が教えてあげるネタとして、恥を忍んで書き残した次第でございます。