Three.jsで重宝しそうな球座標の計算式は以下。
x = Math.cos(rad) * Math.cos(rad2) * r;
y = Math.cos(rad) * Math.sin(rad2) * r;
z = Math.sin(rad) * r;
以下デモ。
http://codepen.io/ykob/details/bdEQdv/
以下のページを参考にしました。
http://fnorio.com/0098spherical_trigonometry1/spherical_trigonometry1.html