svg版

cpp/output_svg.cc

# include <iostream>

# include <openbabel/mol.h>
# include <openbabel/obconversion.h>

int main(int argc, char** argv){
  std::string outfile = "test.svg";

  // input molecule using smiles
  std::string smiles = "c1cc(C(=O)N(C)C)c2cc(C(=O)N)ccc2c1";
  std::stringstream ss(smiles);
  OpenBabel::OBConversion conv(&ss);
  conv.SetInFormat("smi");

  OpenBabel::OBMol mol;
  conv.Read(&mol);

  conv.SetOutFormat("svg");
  conv.WriteFile(&mol, outfile.c_str());

  return 0;
}

これでtest.svgが出力できる。

png版

ところで、svgはいろんな所に対応してなかったりいろいろ不便。vector表現なんだけどなー。
ということで、png版も作る。

cpp/output_png.cc

# include <iostream>

# include <openbabel/mol.h>
# include <openbabel/obconversion.h>

int main(int argc, char** argv){
  std::string outfile = "test.png";

  // input molecule using smiles
  std::string smiles = "c1cc(C(=O)N(C)C)c2cc(C(=O)N)ccc2c1";
  std::stringstream ss(smiles);
  OpenBabel::OBConversion conv(&ss);
  conv.SetInFormat("smi");

  OpenBabel::OBMol mol;
  conv.Read(&mol);

  conv.SetOutFormat("_png2"); //単純にpngではないことに注意
  conv.AddOption("w", OpenBabel::OBConversion::OUTOPTIONS, "500"); //出力幅の設定
  conv.AddOption("h", OpenBabel::OBConversion::OUTOPTIONS, "500"); //出力高さの設定
  
  conv.WriteFile(&mol, outfile.c_str());

  return 0;
}

これならここにも貼れる。

こんな感じ。