環境はUnity5.3.4f1。
Animator.SetTriger("hoge");
としたときに、
Animator has not been initialized.
と警告される。
以下の記事で掛かれているように、
http://forum.unity3d.com/threads/mecanim-issue-animator-has-not-been-initialized.158874/page-2
GameObjectをSetActive( true )にしてからAnimator.SetTrigerするようにしたら、警告がでなくなった。