どうもjavascriptの同期とか非同期の処理がわからなくて四苦八苦している。
取り急ぎpromiseを使うとよいらしいので、作ってみたサンプル。

uploadの処理が終わってから、createとeditをそれぞれ実行して、全部終わってからアラートを出す、というもの。

３つの処理はpromiseでくくっておいて、リターンをresolveに入れておく。
Promise.allを使うとまとめて実行できる、リターンも配列にまとまって返ってくる。

upload().then(function(response) {
    Promise.all( [create(response), edit(response)] ).then(function(res) {
        alert("end");// なにかする
        console.log(res);
        // Array [ "3000000", "2000000" ]
        // resには配列で順番にresolveのリターンが入っている
    });
});

function upload() {
    return new Promise((resolve, reject) => {
        $.ajax({
            url:'api1.php',
            type:'get'
        }).done(function (data) {
            alert(data);
            resolve(data);
        }).fail(function() {
            alert("fault");
            reject;
        });
    });
}

function create(response) {
    return new Promise((resolve, reject) => {
        console.log("create" + response);
        $.ajax({
            url:'api3.php',
            type:'get'
        }).done(function (data) {
            alert(data);
            resolve(data);
        }).fail(function() {
            alert("fault");
            reject;
        });
    });
}

function edit(response) {
    return new Promise((resolve, reject) => {
        console.log("edit" + response);
        $.ajax({
            url:'api2.php',
            type:'get'
        }).done(function (data) {
            alert(data);
            resolve(data);
        }).fail(function() {
            alert("fault");
            reject;
        });
    });
}