git マージリクエスト出す際に、マージ先のブランチに追いつき不要差分を解消する方法

使用したコマンドなどをメモしておく。
もっといい方法あったら教えてください。オネガイシマス。

マージ先:develop ブランチ 最新が aabbcc コミットハッシュ
開発:feature ブランチ

git checkout feature
git merge develop

コンフリクト解消するが、

ここで問題発生
実差分はないように見えるがファイル全行に差分があると表示される。

手元の環境でマージリクエスト先との差分を確認できる

git checkout feature
git diff aabbcc --name-only > difflist.txt

git checkout aabbcc [filepath/filename]