結論から言うと
怒られている.metaファイルを消したあと、Unityを一度終了して起動しなおしましょう。
やったこと
うっかりUnityに関係ないファイルをドラッグドロップで入れてしまい、そのファイルを消したら
A meta data file (.meta) exists but its asset 'Assets/hoge.png' can't be found.～
と警告が出てきました。
.metaファイルも一緒に消せと言っているようなので、ファイルを戻してからプロジェクトフォルダ内のAssetsフォルダにできていた同じ名前の.metaファイルを一緒に削除。
…しても警告が消えない。
なんで!? とさんざん悩んで、Unityを終了して起動しなおせば良いということに気づくのにかなり時間がかかってしまいました。