必要なライブラリのインストール

sudo apt-get update
sudo apt-get -y install git subversion yasm build-essential autoconf libtool zlib1g-dev libbz2-dev libxml2-dev libogg-dev libtheora-dev libvorbis-dev libsamplerate-dev libfribidi-dev libfreetype6-dev libfontconfig1-dev libass-dev libjansson-dev libmp3lame-dev libx264-dev zip unzip tar gzip

エンコード中に「Segmantation Fault」が出力されて失敗するためにlibx264を別でビルド&インストール

sudo apt-get -y build-dep libx264-142
sudo apt-get -y source libx264-142
cd x264-0.142.2389+git956c8d8
sudo ./configure --enable-static --enable-shared --extra-cflags=-fno-aggressive-loop-optimizations
sudo make -j8
sudo cp libx264.so.142 /usr/lib/x86_64-linux-gnu/

Handbrakeビルド

git clone https://github.com/HandBrake/HandBrake.git hb
cd hb
./configure --disable-gtk --disable-x265
cd build
sudo make -j8

コンパイル中に以下のエラーが出るので個別に対処

ERROR: opus not found
/usr/bin/ld: -lharfbuzz not found

libopusを手動でビルド&インストール

handbrakeのソースフォルダ配下「/contrib/libopus」に移動して以下を実行

cat module.defs
～
LIBOPUS.FETCH.url = http://download.handbrake.fr/contrib/opus-1.1.3.tar.gz
～
wget http://download.handbrake.fr/contrib/opus-1.1.3.tar.gz
tar zxvf opus-1.1.3.tar.gz
cd opus-1.1.3
./configure
make -j12 && make install

libharfbuzz-devをインストール

apt-get install libharfbuzz-dev

再度ビルド&インストール

cd build
sudo make -j8 && make install
HandBrakeCLI --version
[11:29:37] hb_init: starting libhb thread
[11:29:37] thread 7f4cd8333700 started ("libhb")
HandBrake 20160929182728-d398531-master