Apache Cordovaでは、iosのWebViewは現状（2015/5/27時点）UIWebViewとなりますが、
プラグインを使うことで、WKWebViewを使うことが可能になります。
使い方は上記ページに書いてある通りですが、特に重要なのは以下の2行です。
cordova platform add ios@4.0.x --usegit
cordova plugin add https://github.com/apache/cordova-plugins.git#master:wkwebview-engine
これでiOS8.0以降ではWKWebViewが使われるようになります。
CDVViewControllerクラスの、createGapViewメソッドあたりでデバッグしてみると、
実際にWKWebViewが使われていることがわかります。
WKWebViewはいずれCordova本体に取り込まれ、プラグイン不要になると思いますが、
それまではプラグインに頼ることになります。
以上です。