ReactDomで、下記のように直接document.bodyにレンダリングすると怒られる

index.js

ReactDom.render(
　　<Main />, 
　　document.body
)

Warning: render(): Rendering components 
directly into document.body is discouraged,
since its children are often manipulated by third-party
scripts and browser extensions. 
This may lead to subtle reconciliation issues. 
Try rendering into a container element created for your app.

サードパーティscriptやextensionがdocument.bodyに依存してる可能性あるからやめておけという警告。とても真っ当。
productionコードなら、<div id="container"></div>のようにdivを書いてそちらを指定して回避する。

が、budoなどを使ってちょこちょこっと素振りやprototypingするときに、index.htmlをいちいち作りたくない。

解決策

createElementを直接appendChildしてそれをターゲットとする。

index.js

ReactDom.render(
　　<Main />,
　　document.body.appendChild(document.createElement('div'))
)

繰り返しになるが、budoのようなprototyping用の想定なので、productionではやらない。おとなしく<div id="container"></div>とhtmlに書く方が良い