手元に転送できる場合

rsync -auv remote_server:/path/to/data ~/local/data/dir

これがいつもできないから記事書いてるのだが、一応まとめておこう。
以下の場合に困難になる：

つまり逆に以下の場合にはこの方法でも行けることになる：

仮想的に手元にあるように扱う

NFS/sshfs等でマウントしてローカルにあるように扱う。
sshfsはSSHの設定さえしてあれば使えるので便利。

sshfs remote_server:/path/to/data ~/local/data/dir

この方法だと(一人で使用している限り)データの同期が自動的に確保されており、
手元のストレージを圧迫しないので大規模なデータを高速なローカルLAN内で扱うのに便利となる。
ただし通信が安定して高速でない場合にはあまり有効ではない。

なるべく通信量を減らすには、解析結果だけを通信すればいい。
例えばipython notebookをサーバーで起動して、そこで解析を行えば生データを通信せずにすむため、
通信量を減らすことができる。
また通信が不安定でも状態がサーバーに残るので再接続も容易となる。

ssh -L 10088:localhost:8888 remove_server
cd /path/to/data
ipython notebook

ipython notebookはデフォルトでlocahostからしか接続できない（？）のでSSHで転送しておく。
これで http://localhost:10088/ でアクセスできる。

難点としては複数のサーバーにデータがまたがっている場合に、
結合的な解析が実行できないことである。
これについては上の方法と組み合わせることで解決できる場合も多いだろう。