spyder-notebookでplotlyを使う

結論

Spyder側で
設定→アプリケーション→詳細設定→レンダリングエンジン→Desktop

に設定し、

import plotly.io as pio
pio.renderers.default = 'iframe'

を実行することでうまく表示できました。以下サンプルです。

import plotly.graph_objects as go
import plotly.io as pio
import numpy as np

pio.renderers.default = 'png'

fig = go.Figure(data=[go.Scatter3d(
    x=np.random.rand(20),
    y=np.random.rand(20),
    z=np.random.rand(20),
    mode='markers',     
    marker={'size':5, 'color':'blue', 'symbol':'circle'}
), ])

fig.show()

補足

3次元plot（等、恐らくWebGLが必要なもの？）が不要であれば、

print(pio.renderers.default)

Renderers configuration
-----------------------
    Default renderer: 'iframe'
    Available renderers:
        ['plotly_mimetype', 'jupyterlab', 'nteract', 'vscode',
         'notebook', 'notebook_connected', 'kaggle', 'azure', 'colab',
         'cocalc', 'databricks', 'json', 'png', 'jpeg', 'jpg', 'svg',
         'pdf', 'browser', 'firefox', 'chrome', 'chromium', 'iframe',
         'iframe_connected', 'sphinx_gallery', 'sphinx_gallery_png']

を色々変えれば表示されることが多いです。

追記

グラフのsvg表示や保存がうまくいかないこともある。環境によってはkaleidoを入れてもうまく動かないので、その場合はorcaを入れる。（requestsも必要。）