背景

VM 1とVM 2は同じVnetにありますが、Subnetは別々です。
さらにVM 1にNic 1とNic2を付けています。Nic1とNic2はそれぞれ別のSubnetです。
この場合、VM1からVM2に接続しますが、VM 1はNic１を使っています。どうすればNic2を使わせますか。
以下は実例を用いてやり方を説明しました。

VM 1:
Nic1:172.17.0.4　(subnet1)
Nic2:172.17.2.4 (subnet2)

VM 2:172.17.1.4 (subnet3)

実機検証

1.VM1にRDPして、tnc -ComputerName 172.17.1.4 -port 3389 を実施してみました。
結果は以下の通り、Source Addressは Nic1を使っていますね。

2.Print routeでroute tableを確認します。

IPv4 Route Table

Active Routes:
Network Destination        Netmask          Gateway       Interface  Metric
          0.0.0.0          0.0.0.0       172.17.0.1       172.17.0.4     10
        127.0.0.0        255.0.0.0         On-link         127.0.0.1    331
        127.0.0.1  255.255.255.255         On-link         127.0.0.1    331
  127.255.255.255  255.255.255.255         On-link         127.0.0.1    331
    168.63.129.16  255.255.255.255       172.17.0.1       172.17.0.4     11
  169.254.169.254  255.255.255.255       172.17.0.1       172.17.0.4     11
       172.17.0.0    255.255.255.0         On-link        172.17.0.4    266
       172.17.0.4  255.255.255.255         On-link        172.17.0.4    266
     172.17.0.255  255.255.255.255         On-link        172.17.0.4    266
       172.17.2.0    255.255.255.0         On-link        172.17.2.4    266
       172.17.2.4  255.255.255.255         On-link        172.17.2.4    266
     172.17.2.255  255.255.255.255         On-link        172.17.2.4    266
        224.0.0.0        240.0.0.0         On-link         127.0.0.1    331
        224.0.0.0        240.0.0.0         On-link        172.17.0.4    266
        224.0.0.0        240.0.0.0         On-link        172.17.2.4    266
  255.255.255.255  255.255.255.255         On-link         127.0.0.1    331
  255.255.255.255  255.255.255.255         On-link        172.17.0.4    266
  255.255.255.255  255.255.255.255         On-link        172.17.2.4    266

上記のroute tableからわかりますが、Gatewayは172.17.0.1を使っています。
VM2への通信は既定の0.0.0.0ルートを利用します。つまり172.17.0.1を使います。
172.17.1.4 への通信では、以下のルートが使用されます：
• ネットワーク宛先：0.0.0.0
• サブネットマスク：0.0.0.0
• ゲートウェイ：172.17.0.1
• インターフェース：172.17.0.4

3.172.17.1.4 への通信をNic2で使いたいですが、どうすればいいでしょうか。
まずIpconfig /all で172.17.2.4がethernet 4であることを把握して、

Ethernet adapter Ethernet 4:
   Connection-specific DNS Suffix  . : mkppgh41gxwu5dqpkrpzlqfeuh.lx.internal.cloudapp.net
   Description . . . . . . . . . . . : Microsoft Hyper-V Network Adapter #2
   Physical Address. . . . . . . . . : 60-45-BD-62-4A-DC
   DHCP Enabled. . . . . . . . . . . : Yes
   Autoconfiguration Enabled . . . . : Yes
   Link-local IPv6 Address . . . . . : fe80::cb25:aee:3100:95ad%12(Preferred)
   IPv4 Address. . . . . . . . . . . : 172.17.2.4(Preferred)
   Subnet Mask . . . . . . . . . . . : 255.255.255.0

次はいかのコマンドでEthernet 4のidx番号は6であることを把握します。

netsh interface ipv4 show interfaces

Idx     Met         MTU          State                Name
---  ----------  ----------  ------------  ---------------------------
  1          75  4294967295  connected     Loopback Pseudo-Interface 1
  3          10        1500  connected     Ethernet
  6          10        1500  connected     Ethernet 4

4.以下のコマンドで172.17.1.4への通信は 172.17.2.1(Nic2のgateway IP)を使うように静的ルートを設定します。
route -p add 172.17.1.4 mask 255.255.255.255 172.17.2.1 if 6 metric 10

5.route printで結果を確認、確かに以下のルートが追加されました。Metricは10でdefaultGatewayのmetricと同じです。

Persistent Routes:
Network Address Netmask Gateway Address Metric
172.17.1.4 255.255.255.255 172.17.2.1 10

C:\Users\tanhiroshi>route print

IPv4 Route Table
===========================================================================
Active Routes:
Network Destination        Netmask          Gateway       Interface  Metric
          0.0.0.0          0.0.0.0       172.17.0.1       172.17.0.4     10
        127.0.0.0        255.0.0.0         On-link         127.0.0.1    331
        127.0.0.1  255.255.255.255         On-link         127.0.0.1    331
  127.255.255.255  255.255.255.255         On-link         127.0.0.1    331
    168.63.129.16  255.255.255.255       172.17.0.1       172.17.0.4     11
  169.254.169.254  255.255.255.255       172.17.0.1       172.17.0.4     11
       172.17.0.0    255.255.255.0         On-link        172.17.0.4    266
       172.17.0.4  255.255.255.255         On-link        172.17.0.4    266
     172.17.0.255  255.255.255.255         On-link        172.17.0.4    266
       172.17.1.4  255.255.255.255       172.17.2.1       172.17.2.4     20
       172.17.2.0    255.255.255.0         On-link        172.17.2.4    266
       172.17.2.4  255.255.255.255         On-link        172.17.2.4    266
     172.17.2.255  255.255.255.255         On-link        172.17.2.4    266
        224.0.0.0        240.0.0.0         On-link         127.0.0.1    331
        224.0.0.0        240.0.0.0         On-link        172.17.0.4    266
        224.0.0.0        240.0.0.0         On-link        172.17.2.4    266
  255.255.255.255  255.255.255.255         On-link         127.0.0.1    331
  255.255.255.255  255.255.255.255         On-link        172.17.0.4    266
  255.255.255.255  255.255.255.255         On-link        172.17.2.4    266
===========================================================================
Persistent Routes:
  Network Address          Netmask  Gateway Address  Metric
       172.17.1.4  255.255.255.255       172.17.2.1      10
===========================================================================

6.tnc -ComputerName 172.17.1.4 -port 3389 を実施したら、SourceAddressが172.17.2.4になりました！成功！

7.該当routを削除したら、Source Addressはまた172.17.0.4に戻りました。
C:\Users\tanhiroshi>route delete 172.17.1.4 mask 255.255.255.255
OK!

補足：

検証する際、間違って、Nic2のgateway IPではなく、Nic2のIpをルートに設定したら、tncは失敗しますし、Source Addressも172.17.0.4のままです。ここは要注意ですね。

C:\Users\tanhiroshi>route -p add 172.17.1.4 mask 255.255.255.255 172.17.2.4 if 6 metric 10
 OK!