以下のyoutubeがとても参考になりますが、OpenCVをandroid Studioで使用するたびに毎回見ているので、メモになります。まったくのandroid初心者丸出しで、間違ったところもあるかもしれませんが、見逃してください。
参考：youTube

#1.OpenCVをダウンロード
以下からまずダウンロードをします。
http://opencv.org/downloads.html
#2.適当なandroidのプロジェクトを作成
Android Studioで新しいプロジェクトを作成します。
#3．「libs」というディレクトリを作成
プロジェクトにlibsというディレクトリを作成

#4.libsへsdk/javaをペースト
先ほどダウンロードし解凍を行った「OpenCV-android-sdk」から「openCV/OpenCV-android-sdk/sdk/java」をコピーし、libsへペースト

#5.javaフォルダをリネームし「opencv」へ

#6.opencvフォルダの中に新規ファイルでbuild.gradleを作成

#7.上記で作成したbuild.gradle　以下をコピーペースト

apply plugin: 'android-library'

buildscript {
    repositories {
        mavenCentral()
    }
    dependencies {
        classpath 'com.android.tools.build:gradle:1.3.0'

        // NOTE: Do not place your application dependencies here; they belong
        // in the individual module build.gradle files
    }
}

android {
    compileSdkVersion 23
    buildToolsVersion "23.0.0"

    defaultConfig {
        minSdkVersion 19
        targetSdkVersion 23
        versionCode 3000
        versionName "3.0"
    }
    sourceSets{
        main{
            manifest.srcFile 'AndroidManifest.xml'
            java.srcDirs = ['src']
            resources.srcDirs = ['src']
            res.srcDirs = ['res']
            aidl.srcDirs = ['src']

        }
    }
}

#8.setting.gradleに以下を追加し、「Sync Now」をクリックし、エラーがないことを確認

include ':libs:opencv'

#9.以下に「jniLibs」ディレクトリを作成
/openCV/OpenCVtest05/app/src/main/

#10.OpenCV-android-sdkの以下「libs」の中身をコピーし「jniLibs」フォルダにペースト
/OpenCV-android-sdk/sdk/native/libs

#11.SDKの登録を行います。
File -> Project Structureを選択

#12.Modules -> Dependenciesから右下の「+」をクリックし、「3 Module dependency」をクリックし、「:libs:opencv」を追加

#13.最後に動くか確認します。
app -> src -> main -> java -> package名　-> MainActivityに以下を追加

static {
        if(!OpenCVLoader.initDebug()){
            Log.i("opencv", "initialization failed");
        }else{
            Log.i("opencv", "initialization successful");
        }
    }

14.ビルドして、Logが出ればOpenCVを使う準備完了