設定方法
Settings 
Packagesから autosaveで検索してCore Packages の settings から Enabled にチェックを入れる。
別の方法：config.csonを編集することでも変更できる。
config.cson
autosave:
enabled: true
ウィンドウを閉じたりフォーカスが外れると自動でセーブされるので、コードの確認に便利かなぁと。
パッケージの説明はこちら（atom.io）
つい最近、ATOM使い始めました。
……最初から入ってるなら、もっと簡単に設定できてもいいんじゃないかな！ かな！