あるarrayから特定のインデックス以外を抽出する方法です。

# 0~99の数字からランダムに10個取ってくる
arr = np.random.randint(0, 100, 10)
# > array([74, 29,  6, 79, 76, 13,  3, 56, 25, 50])

# 奇数番目の数値をarrから除外したい
odd = [1,3,5,7,9]

# 方法① リスト内包表記
index = [i for i in np.arange(len(arr)) if i not in odd]
arr_even = arr[index]

# 方法② True/Falseでマスキングする
index = np.ones(len(arr), dtype=bool)
index[odd] = False
arr_even = arr[index]

# 方法③ np.delete
arr_even = np.delete(arr, odd)

方法③が一番スッキリしていますが、~~どれも時間的にはあまり変わらないのでお好きな方法でどうぞ。~~
そんなわけありませんでした！

@nkay さんが検証してくれました。（コメント参照）

方法②と方法③はあまり変わらないですが、方法①はarrayのサイズが大きくなると遅くなってしまいますね。

コードも置いておきます。
https://github.com/si1242/machine_leraning_experiments/blob/master/20200605_comparison_qiita.ipynb