※phpcsにpathが通っている前提です。
現在使用可能な規約
$ phpcs -i
The installed coding standards are PEAR, Zend, PSR2, MySource, Squiz, PSR1 and PSR12
自作ルールの格納ディレクトリを確認
$ phpcs --config-show
Using config file: /Users/hoge/.composer/vendor/squizlabs/php_codesniffer/CodeSniffer.conf
installed_paths: /Users/hoge/.phpcs
# installed_paths: 〜 が自作ルールを入れるフォルダ。
自作ルールの格納ディレクトリを指定
# installed_pathsは上書きされるので注意。(この場合 /Users/hoge/.phpcs の指定が消える。)
$ phpcs --config-set intalled_paths path/to/standarts/dir