以下の組み合わせでPyinstallerが動くことを確認しましたので報告します。

#環境

Windows10 Home, Anaconda3
python3.7.x
pyinstaller 3.5

よく使うコマンド(自分用)（具体化は甘えか...）

pyinstaller main.py --exclude-module=PyQt5 --noconsole

pyinstaller main.py --onefile

pyinstaller main.py --onefile --noconsole

*onefile化は一時ファイルを作成する必要があり低速化を招くので注意。出典

#上手なpyinstallerの使い方？
以下の操作を行うことでいくつかの利点がある。

無駄なパッケージを読み込まないでよくなる
ファイルサイズが小さくなる
exeファイルを高速に作成可能になる

仮想環境（venv）用意する
仮想環境は種類があるが、python公式のvenvがいいと思う。参考

VScodeで仮想環境を作ろうと思ったら、作業ディレクトリに.venvが作成されなかった。
-> コマンドプロンプトから直接作成する必要がある。

作成方法.

python -m venv 仮想環境名

起動方法.

./仮想環境のディレクトリ名/Scripts/activate

と入力すればおっけ。
2. pandas, numpy などの巨大なパッケージに注意参考

pyinstaller起動・ファイル作成

#バージョンの確認方法
python

python -V

pyinstaller

pyinstaller -v

#動作確認OK!!
(including: pyautogui, numpy)
python3.6.5(python-3.6.5-amd64.exe), pyinstaller3.4, numpy1.15.4

python ver	pyinstaller ver	numpy ver
3.6.9(Anaconda3)	3.4	1.15.4
3.6.9(Anaconda3)	3.4	1.16.4
3.6.9(Anaconda3)	3.4	1.16.5
3.6.9(Anaconda3)	3.5	1.16.5
3.7.3(Anaconda3)	3.5	1.16.5
3.7.3(Python3)	4.0	1.19.2

(with --onefile, --exclude-module PyQt5)

#動作失敗
(including: pyautogui, numpy)

python ver	pyinstaller ver	numpy ver
3.6.5	3.4	1.17
3.6.6	3.5	1.17
3.8.6	4

##エラーメッセージ

pynputとpyinstallerの相性
pynput 1.6.8と pyinstaller 1.19.2で動作確認
https://stackoverflow.com/questions/63681770/getting-error-when-using-pynput-with-pyinstaller
pyinstaller と numpy の相性が合わない¹

>ImportError: numpy.core.multiarray failed to import
Traceback (most recent call last):...
...
ModuleNotFoundError:No module named'numpy.random.common'
[]Failed to execute script ***

[解決法]
わたしの場合は、python3.6.5(python-3.6.5-amd64.exe), pyinstaller3.4, numpy1.15.4にしたら解決できました

PyQt5が読み込めていない

Exception:
            Cannot find existing PyQt5 plugin directories
            Paths checked: C:/qt64/qt_1544645195969/_h_env/Library/plugins

[解決法]
Pyinstallerはデフォルトで要らないモジュール・パッケージまで含めてしまうようです。²
PyQt5を使用していないなら、これを含めなければエラーが出てきません。（根本的な解決ではありませんが…）

pyinstaller main.py --exclude-module=PyQt5

configparserでうまくファイルが読み込めない!
作業ディレクトリを確認する
コマンドプロンプトから開く場合、プロンプトに表示されているところが作業ディレクトリになる。

#試すべきこと

numpy update
他環境のnumpyを参照していないか

 import sys
 sys.path

コードごとの容量の違い(pyinstaller version 3.4 + python)

pyinstaller 任意.py

A.py

print('a')

B.py

import tkinter
print('a')

	A	B
容量	13.8 MB	20.7 MB
spec file	-	Aと同じ

C.py

import tkinter as tk
root = tk.Tk()
root.mainloop()

D.py

import tkinter as tk
root = tk.Tk()
for i in range(30):
    button = tk.Button(text = '{}'.format(i))
    button.pack()
root.mainloop()

	C	D
容量	20.7 MB (21,777,172 バイト)	20.7 MB (21,777,260 バイト)
spec file	Aと同じ	Aと同じ
MKLを入れていない環境	20.0 MB (21,038,144 バイト)

pyinstaller 任意.py --onefile

	C	D
容量	9.15 MB (9,603,958 バイト)	9.15 MB (9,600,748 バイト)
spec file	Aと同じ	Aと同じ

MacBookで使う際の注意点

2018年の段階ではPyinstallerで作成されたExeファイルを開くと滲む不具合？があるようです。
解決法は次のURLを参照→https://qiita.com/cheuora/items/39b3203400e1e15248ed

#参考

完全に趣味でPythonをいじっているので、間違っていることがあったらごめんなさい。
細かいことでもいいので、コメント欄でご指摘いただけると、わたしの勉強になりますので、お気軽にどうぞ～。

以上

Standalone Executable Created by PyInstaller Can't Import Numpy
[1]. Standalone Executable Created by PyInstaller Can't Import Numpy ↩
[Pyinstaller automatically includes unneeded modules]
[2]. Pyinstaller automatically includes unneeded modules ↩