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Nanoplotをcondaでinstallする際に気をつけること[備忘録]

Last updated at Posted at 2024-03-25

condaでロングリード(Nanopore read)用のクオリティ分析ツールである、Nanoplotをinstallした。
しかし、

$ conda install -c bioconda nanoplot

では導入できなかった。

調べてみるとtwitter (X)にて、@drk0311さんが以下のように言及していた。

ということで、以下のようにpipでNanoplotをinstallしてみた。

$ conda create -n nanoplot python=3.7 pip
$ conda activate nanoplot
$ pip install nanoplot

この方法では、Nanoplotをinstallできた。

@drk0311さんは2020/10/22にtweetしているが、2024/3/25現在も、pipでinstallするしか方法がなさそう。

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