コンテナ内に入ります。
コマンド
docker-compose exec mysql bash
接続して、そのあとでファイルを実行するのですが、ローカルとmysqlの同期ディレクトリ内にsqlファイルを置く必要があります。
例えば、docker-compose.ymlのmysqlのvolumesが ./db:/var/lib/mysqlだったら、ローカルのdbディレクトリ内に置きます。
コマンド
cd /var/lib/mysql
mysql -u root -p DB名 < ○○.sql
でパスワード入力すれば動きます。