Gitでパニックになりつつあるので、手順を整理。

①リモートブランチと対になっているローカルブランチを
　ダブルクリックし、カレントブランチとしてからフェッチを実行
②プルを実行
③自分のブランチを選択してダブルクリックし、
　カレントブランチとする。
④　①のローカルブランチを選択して右クリックし、
　「現在のブランチに①ブランチをマージ」をクリックして
　マージする。

これで元のブランチが汚れず自分のブランチへ最新がマージされるはず。

ログを追加して解析しているだけなので自分のブランチへ最新ソースが
反映されればOK

誤った点があればご指摘ください。
Git始めたばかりで各部位の名前がわかっていない。