skimage.io.imreadのpluginオプション

以下のように読み込みで使うプラグインを指定できる。

# matplotlibで読み込む
skimage.io.imread(fname='lenna.png', plugin='matplotlib')

# pilで読み込む
skimage.io.imread(fname='lenna.png', plugin='pil')

公式サイトのこの辺りに説明が書いてある。
- http://scikit-image.org/docs/stable/api/skimage.io.html#imread

plugin : str, optional
Name of plugin to use. By default, the different plugins are tried (starting with the Python Imaging Library) until a suitable candidate is found. If not given and fname is a tiff file, the tifffile plugin will be used.

対応しているプラグインの一覧は、skimage.io.find_available_plugins()で調べられる。
- http://scikit-image.org/docs/stable/api/skimage.io.html#skimage.io.find_available_plugins
- 実行中の環境にインストールしていないプラグインも出てくるので、必要ならインストールする。

測定

インストールしていないプラグインは除外して以下のように測定した。

import skimage.io

plugins = skimage.io.find_available_plugins()

for name in plugins:
    # 除外
    if name in ['qt', 'gdal', 'gtk', 'simpleitk', 'fits', 'tifffile']:
        continue
    
    print(name)

    skimage.io.use_plugin(name)
    %timeit skimage.io.imread(fname='lenna.png', plugin=name)

    print('---')

参考までに私の環境での測定結果を載せておく。

imread
8.88 ms ± 2.08 ms per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 100 loops each)
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pil
20.1 ms ± 892 µs per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 10 loops each)
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matplotlib
37.8 ms ± 6.65 ms per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 10 loops each)
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imageio
25.1 ms ± 5.67 ms per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 100 loops each)
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