Treasure Agent(td-agent)とAmazon Linuxの関係について，現状を簡潔にまとめておきます．

非サポート対象

td-agent v1 vs. td-agent v2のSupported Platformsに書いてますが，現状Treasure AgentはRedHat/CentOSの5/6向けのRPMを提供しています(7も近々出します)．Amazon LinuxはRHELベースでRPMを使っているので，サポート対象に入っていると思われるかもしれませんが，実際は非サポートです．理由はいくつかあります．

Amazon Linuxは俺俺バージョニングを採用していて，安定したサポートが難しい．$releaseverがlatestなのもつらい
- Treasure Dataが提供している http://toolbelt.treasuredata.com/sh/install-redhat-td-agent2.sh のインストールスクリプトではエラーになります
Amazon Linuxのために特別なビルドプロセスを採用するのがコスト
RHELとの互換性が維持されてない箇所があるが，それを調べてサポートするのが難しい

以下はfujiwaraさんのtweetですが，やはりサポート対象にするには少し懸念事項があります．

Amazon Linux, 2013.09まではわりとCentOS/RHEL6のつもりでRPM入れても動いたけど2014.03からは別物と思ったほうがいいですね。glibcとかperlとか変わってるから
— fujiwara (@fujiwara) September 17, 2014

Treasure Agentを使うには…

以下の3つが考えられます．

Treasure Agentに限らず，Amazon Linux上でRHEL向けのRPMが動くかどうかの保証はないので，利用するパッケージが問題なく動くかどうかちゃんと確認してから使う
Treasure Agentを実際に使っているAmazon Linuxで再ビルドする
- td-agent 2: https://github.com/treasure-data/omnibus-td-agent
- td-agent 1: https://github.com/treasure-data/td-agent
fluentd gemを直接使う

実際の所，Treasure Dataが配布しているRPMを使ってAmazon Linuxで動かしている人たちはいるので，クリティカルな問題は現状ないとは思っていますが，心配な方はTreasure Agentを再ビルドした方が良いとは思います．

Amazon Linux側の問題が解決され，ユーザがかなり増えればサポートをする可能性はありますが，難しいというのが現状です．