事務作業系のアプリなら必要性あるのでは。
WA_InputMethodEnabled,false は無いとwindowsで難ありなので。
keyPressEventは、del back キーで消去されたように見えて消去されていないからです。

from PySide2 import QtCore, QtGui, QtWidgets
from PySide2.QtWidgets import QSpinBox

class myIntegerBox(QSpinBox):
    def __init__(self, parent=None):
        super().__init__(parent)
        self.setAlignment(QtCore.Qt.AlignRight|QtCore.Qt.AlignTrailing|QtCore.Qt.AlignVCenter)
        self.setProperty("showGroupSeparator", True)
        self.setAttribute(QtCore.Qt.WA_InputMethodEnabled,False)
        self.setButtonSymbols(QtWidgets.QAbstractSpinBox.NoButtons)

    def keyPressEvent(self,event):
        super().keyPressEvent(event)

        # del back space で0 セット
        if event.key() == QtCore.Qt.Key_Delete:
            self.setValue(0)
        if event.key() == QtCore.Qt.Key_Backspace:
            self.setValue(0)
        if event.key() == QtCore.Qt.Key_Space:
            self.setValue(0)

カーソルの位置などに依然難ありです。