Shift_JIS の文字を Unicode に変換する際、文字エンコーディング（＝変換テーブル）が異なると問題になることがある。

Shift_JIS

Shift_JIS では「あ」を「0x82A0」、「い」を「0x82A2」、「う」を「0x82A4」で表すように決められている。
Shift_JIS のテキストファイルで「あいう」と書いて、バイナリエディタで開くと確認できる。

あ 0x82A0 (Shift_JIS)
い 0x82A2 (Shift_JIS)
う 0x02A4 (Shift_JIS)

図．バイナリエディタでShift_JISのテキストファイルを開いたところ

Shift_JIS -> Unicode 変換 (MS932)

Shift_JIS と Unicode では文字（上の例では「あ」）とコード（上の例では「0x82A0」）の割り当てが異なっているので、変換ルール（文字エンコーディング）が決められている。Windows Java での標準文字エンコーディングである MS932 を使うと、Shift_JIS の「あいう」は以下のように変換される。

あ 0x82A0 (Shift_JIS) -> U+3042 (Unicode) MS932で変換した結果
い 0x82A2 (Shift_JIS) -> U+3044 (Unicode) MS932で変換した結果
う 0x02A4 (Shift_JIS) -> U+3046 (Unicode) MS932で変換した結果

MS932で変換した結果はJava のツールである native2ascii を使っても確認できる。

native2ascii -encoding MS932 sjis_abc.txt
\u3042\u3044\u3046

日本語文字列でよく使われる文字エンコーディングには MS932C だけでなく Cp943C というのも存在する。
Cp943C を使って「あいう」をUnicodeに変換しても結果は同じである。

あ 0x82A0 (Shift_JIS) -> U+3042 (Unicode) Cp943Cで変換した結果
い 0x82A2 (Shift_JIS) -> U+3044 (Unicode) Cp943Cで変換した結果
う 0x02A4 (Shift_JIS) -> U+3046 (Unicode) Cp943Cで変換した結果

native2ascii でも以下の通り。

native2ascii -encoding Cp943C sjis_abc.txt
\u3042\u3044\u3046

ところが一部の文字

－ 0x817C (Shift_JIS)
― 0x815C (Shift_JIS)
～ 0x8160 (Shift_JIS)
∥ 0x8161 (Shift_JIS)
￤ 0xFA55 (Shift_JIS)

などについては、MS932とCP943C のそれぞれでUnicodeに変換されたとき、割り当てられるUnicode 文字が異なってしまう。これはバグではなくエンコーディングの仕様です。
↓
バグではなく、エンコーディングの仕様

表にすると以下のようになる。

文字	Shift_JIS	MS932でのUnicode変換結果	Cp943CでのUnicode変換結果
－	0x817C	u+FF0D	u+2212
―	0x815C	u+2015	u+2014
～	0x8160	u+FF5E	u+301C
∥	0x8161	u+2225	u+2016
￤	0xFA55	u+FFE4	u+00A6

「ユニコード名」を表に加えると以下の通り。

文字	Shift_JIS	MS932でのUnicode変換結果	Cp943CでのUnicode変換結果
－	0x817C	－ u+FF0D (FULLWIDTH HYPHEN-MINUS)	− u+2212 (MINUS SIGN)
―	0x815C	― u+2015 (HORIZONTAL BAR)	— u+2014 (EM DASH)
～	0x8160	～ u+FF5E (FULLWIDTH TILDE)	〜 u+301C (WAVE DASH)
∥	0x8161	∥ u+2225 (PARALLEL TO)	‖ u+2016 (DOUBLE VERTICAL LINE)
￤	0xFA55	￤ u+FFE4 (FULLWIDTH BROKEN BAR)	¦ u+00A6 (BROKEN BAR)

以下は native2ascii での結果。

native2ascii -encoding MS932 sjis.txt
\uff0d\u2015\uff5e\u2225\uffe4

native2ascii -encoding Cp943C sjis.txt
\u2212\u2014\u301c\u2016\u00a6

以下リンクからの転載記事です。
https://sites.google.com/site/myitmemo/java-kanren/unicode/ms932-vs-cp943c