背景

研究（物性）で大量の実験データを扱うが、紙の実験ノートでは流石にデータのサルベージが大変なので、電子実験ノートで記録したかった。
やりたかったこととして、

最低限、日記的にやったことを書いて、タグ（実験装置、サンプル）ごとに検索できること。
無料であること（できれば、OSSであること）　
- 金払い忘れてデータ消えたりしたら困るので。
- 少なくとも、データ容量が不足することがないこと。
- これを満たすのはオンプレしかなかった。
あわよくば、大量の生データを保管するために、オンプレで管理したい（数百GB）。

雰囲気は実際にまず触ってみればわかるかと思う。（登録も不要でさわれる。もちろんデモなので重いしファイルサイズ制限もある）

手順

環境

Fedoraが動くサーバー
SSH等でターミナルは叩ける
ルーターについてきたDDNSサービス（ドメインを持っているならば持っているに越したことはない）

Docker、Docker-composeインストール

sudo dnf install dockerをやってはいけない。
公式から落としてきてインストールすること。詳細は以下の記事参照。

新しい環境なので、以下のコマンドを実行するだけである。

$ sudo dnf config-manager --add-repo https://download.docker.com/linux/fedora/docker-ce.repo
$ sudo dnf install containerd.io docker-ce docker-ce-cli docker-ce-rootless-extras docker-compose-plugin

サービスを起動する。一応テストもしておこう（最終行）。

$ sudo systemctl start docker
$ sudo systemctl enable docker
$ sudo docker run hello-world

ウェルカムメッセージが表示されたら正解。

elabctlインストール

依存しているらしいので、必要なパッケージは入れる。

sudo dnf install dialog git zip unzip

curlで落としてきて、管理スクリプトをインストールする。（Docker-compose.yml直書きはやめといたほうがいいと思った。）

$ curl -sL https://get.elabftw.net -o elabctl && chmod +x elabctl
$ sudo sudo mv elabctl /usr/local/bin/

eLabFTW設定ファイルの作成

管理コマンドから、本体をインストールしていく。

$ sudo elabctl install

仰々しい画面が表示されるが、「OK」

その後、データの保存場所の確認が出るが、基本サーバ用のデータは大きなHDD等においておきたいはずなので、「Download example conf and quit」を選ぶ。

sudo vi elabctl.conf

を開いて、以下のようにコメントアウトを外して書き換えれば良い。以下は大型ストレージを/mnt/serverにマウントしている場合。

# where do you want your backups to end up?
declare BACKUP_DIR='/mnt/server/elabftw/var/backups/elabftw'

# where do we store the config file?
declare CONF_FILE='/mnt/server/elabftw/etc/elabftw.yml'

# where do we store the MySQL database and the uploaded files?
declare DATA_DIR='/mnt/server/elabftw/var/elabftw'

これで保存して閉じる。

$ sudo elabctl install

で、「OK」→「Looks good to me」→「Server」→「Yes」→使うアドレス（私の場合は***.iobb.net）→「Use HTTPS」→「Use correct certificate」→「OK」
これで一旦インストールが完了する。

注意点

先に/mnt/server/elabftw/etc/をmkdirで作成しておかないと、エラーが出る。

ファイアウォールとルーター（DNS）の設定

ファイアウォールを開く。有効なゾーン名はsudo firewall-cmd --list-allでわかる。今回はゾーン名がFedora特有となっていたので、これに設定する。

$sudo firewall-cmd --zone=FedoraWorkstation --add-service=http --permanent
$sudo firewall-cmd --zone=FedoraWorkstation --add-service=https --permanent
$sudo firewall-cmd --reload
$sudo firewall-cmd --list-all

で、http,httpsが入っていたらOK。

ルーター側でDNSの設定をする。ドメインを持っているのなら、その設定をする。ここだけは詳細は調べてください。

証明書インストール（Let's encrypt）

証明書をインストールする。certbotというやつが提供されているので、使う。
先に、80ポートで何も動いていない状態にすること。既にelabctl startしてしまったのなら、一回elabctl stopで先に止めておく。

$ sudo install certbot
$ sudo certbot certonly

あとは公開用メールアドレスと、サイト名（先程のインストールで打ち込んだはず。私の場合は***.iobb.net）を打ち込む。

confファイルの設定（アップロードファイルサイズの変更）

設定ファイルを編集する。インストール時に設定した場所（例では/mnt/server/elabftw/etc/elabftw.yml）にある。以下のように書き換えたら良い。

#- PHP_MAX_EXECUTION_TIME=120
（中略）
#- MAX_PHP_MEMORY=256M
（中略）
#- MAX_UPLOAD_SIZE=100M

これを、

#- PHP_MAX_EXECUTION_TIME=1200
（中略）
#- MAX_PHP_MEMORY=1000M
（中略）
#- MAX_UPLOAD_SIZE=1000000M

（タイムアウト長時間化、メモリリミット拡大、ファイルサイズリミット拡大。前半2つはおまじない程度）

起動

$ sudo elabctl start
$ sudo elabctl initialize

完了したらすぐにブラウザから（今回ならhttps://***.iobb.net）アクセスしてユーザー登録する。

メールの設定

smtp2goを使うようにすすめられるが、会社emailがないと駄目らしいので却下。gmailでやる。
画面右上→Sysadmin Panel→EMAILで、↓のようにセットアップする

完了

以上で完了のはず。

感想

ディレクトリ作るとか、Let's encrypt回りとか、しょうもないところで時間を食った。それ以外は比較的スムーズだった。