SELECTしてINSERTしようとした時に，下記のエラーが出た．
どうやらデータが多くバッファプールが足りなくなったようです．

ERROR 1206 (HY000): The total number of locks exceeds the lock table size

そのため，~/etc/my.confに
innodb_buffer_pool_size=404750336
を追記．sudo権限必要です．

~/etc/my.conf

innodb_buffer_pool_size=404750336

更新したら再起動．

$ mysql.server restart

確認すると

> show variables like 'innodb_buffer_pool_size';
+-------------------------+-----------+
| Variable_name           | Value     |
+-------------------------+-----------+
| innodb_buffer_pool_size | 536870912 |
+-------------------------+-----------+
1 row in set (0.00 sec)

足される形になるんですね．

いろいろ調べてみると

https://qiita.com/mita2/items/8fd915164f0851c96e54
こちらの記事が参考になりました．