前提

お名前.comで取得した独自ドメインを使う
example.com
https://help.onamae.com/answer/14363
お名前メールを使っている
そのためネームサーバがレンタルサーバー SDプラン、お名前メール向けネームサーバー

問題

お名前.comコントロールパネルのDNSレコード設定より以下を登録してもshopify管理画面でドメインが接続できない。

HOST	TYPE	VALUE
example.com	A	23.227.38.65
www.example.com	CNAME	shops.myshopify.com

結論

お名前.comコントロールパネルのグローバルメニュー
メニュー一覧
お名前メール
コントロールパネルにログイン
独自ドメイン設定
対象ドメインの「DNS設定」

と遷移し、A/CNAMEをここに登録する。
お名前.comのネームサーバではなく、お名前メールのコントロールパネルからお名前メールのネームサーバにDNSレコード登録する必要があった。
→ドメイン管理画面でレンタルサーバー SDプラン、お名前メールのネームサーバーを使うように設定しているので当然

参考

https://help.shopify.com/ja/manual/domains/managing-domains/secure-connections
https://help.shopify.com/ja/manual/domains/add-a-domain/connecting-domains

次の問題::送信元メールアドレスが通らない（※おそらく解決済み）

現象

shopify管理画面→ストアの詳細→連絡先情報 で設定する送信元のメールアドレスの疎通確認ができず、

お客様には、代わりにno-reply@shopify.comが表示される可能性があります。
と警告がでる。

対応とそれによって生じた問題

hoge._domainkey CNAME ***
fuga._domainkey CNAME ***
piyo._domainkey CNAME ***
mailervyn CNAME ***
とDNSレコードに登録すれば良いと表示されるのだが、やはりというかお名前.comのネームサーバに登録しても無意味だったため、お名前メールのネームサーバに登録する必要があると思われる。
~~しかしお名前メールのネームサーバのDNSレコードにはCNAMEが登録できない模様。~~
~~一応同管理画面には~~

~~※CNAMEレコードの設定は、上記Aレコードからの変更ボタンから設定できます。~~

~~と記載があるが、登録できない。~~
23.6.26時点でCNAME登録できるようになっていた。

公式活用ガイドを見る

http://guide.onamae-server.com/sd/4_16_20_110_5/
こちらの手順を参考にhoge._domainkeyをサブドメインとして登録を試みたが、

エラーが発生しました。
サブドメインに使用できる文字は、半角英数字、半角ハイフン（-）、ドットのみです。またドット
を連続する事はできません。

となり、登録できない。

結果

登録できず詰む。
ただしこれによる問題がshopifyからお客様に送られるメールアドレスが任意のメールアドレスではなくno-reply@shopify.comになるだけであれば致命的ではない。
しかし「このメールアドレスには返信できません」といった記載や、メールをスレッドで管理できない等の問題は残る。