ファイルを保存してから、文字コード・改行コード違ったとなったときに
文字コードセット、改行コードだけを変更して上書保存が案外面倒だなと思ったので

「名前を付けて保存」　→　（ファイル名は変更せず同じファイル名で）文字コードセット、改行コードを変更して保存

という上書き保存操作をマクロにした。
一度保存されてファイル名（ファイルパス）が設定されている前提。

使用しているサクラエディタ：
v2.4.1.2849 32bit (tag v2.4.1)

template（コード変更なし）

指定できる文字コードは、サクラエディタヘルプの「名前を付けて保存」参照

SK_上書保存_コード変更なし.js

// サクラエディタマクロ  WSH(JScript)
// -----------------------------------
// 編集中ファイルを
//   文字コード：
//   改行コード：
// で上書き保存
// -----------------------------------

var strPath = ExpandParameter("$F");

Editor.FileSaveAs( strPath, -1, 0 );

// -----------------------------------
// FileSaveAs
//   arg2 文字コード
//     -1 変更しない
//      0 SJIS
//      4 UTF-8
//
//   arg3 改行コード
//      0 変更しない
//      1 CRLF(Windows)
//      2 LF(UNIX)
//      3 CR(Mac)

自分用

文字コード：SJIS　改行コード：CRLF

SK_上書保存_SJIS_CRLF.js

// サクラエディタマクロ  WSH(JScript)
// -----------------------------------
// 編集中ファイルを
//   文字コード：SJIS
//   改行コード：CRLF
// で上書き保存する
// -----------------------------------

var strPath = ExpandParameter("$F");

Editor.FileSaveAs( strPath, 0, 1 );

文字コード：SJIS　改行コード：LF

SK_上書保存_SJIS_LF.js

// サクラエディタマクロ  WSH(JScript)
// -----------------------------------
// 編集中ファイルを
//   文字コード：SJIS
//   改行コード：LF
// で上書き保存する
// -----------------------------------

var strPath = ExpandParameter("$F");

Editor.FileSaveAs( strPath, 0, 2 );

文字コード：UTF-8　改行コード：CRLF

SK_上書保存_UTF8_CRLF.js

// サクラエディタマクロ  WSH(JScript)
// -----------------------------------
// 編集中ファイルを
//   文字コード：UTF-8
//   改行コード：CRLF
// で上書き保存する
// -----------------------------------

var strPath = ExpandParameter("$F");

Editor.FileSaveAs( strPath, 4, 1 );

文字コード：UTF-8　改行コード：LF

SK_上書保存_UTF8_LF.js

// サクラエディタマクロ  WSH(JScript)
// -----------------------------------
// 編集中ファイルを
//   文字コード：UTF-8
//   改行コード：LF
// で上書き保存する
// -----------------------------------

var strPath = ExpandParameter("$F");

Editor.FileSaveAs( strPath, 4, 2 );