ESLintなどのフロントエンドまわりのツールでは、設定ファイルのフォーマットとして、JSON、YAML、JavaScript、TypeScriptなど、様々なフォーマットがサポートされています。

TypeScriptがサポートされていれば設定に対して型をつけられるので、間違いをある程度防ぐことができるでしょう。
ここでは、ESLintのようにTypeScriptがサポートされていない設定ファイルに対して、型をつける方法を紹介します。

TypeScriptがサポートされている場合

JestのようにTypeScriptがサポートされていれば、普通にTypeScriptで書くだけです。

import type { Config } from 'jest'

const config: Config = {
  verbose: true
}

export default config

TypeScriptがサポートされていない場合

ESLintのようにTypeScriptがサポートされていない場合でも、型定義さえあればJSDocコメントで型をつけることができます。

たとえば、ESLintの場合は次のように書くことができます。

// @ts-check

/** @typedef {import('eslint').ESLint.ConfigData} ConfigData */

/** @type {ConfigData} */
const config = {
  extends: [
    '@munierujp/eslint-config-typescript'
  ],
  parserOptions: {
    project: './tsconfig.json'
  }
}

module.exports = config

ただし、型定義の場所がドキュメントに記載されていない場合は、自分で探し出す必要があります。
もっとも、著名なツールならGitHubを@ts-check path:<設定ファイル名>のようなクエリで検索すれば使用例が見つかるでしょう。