メモとして残します。
■やり方
with WScript.CreateObject("Excel.Application")
.DisplayAlerts = False ' アラートダイアログを表示しない。
Set book = .WorkBooks.Open("開くエクセルファイルのパス")
Set sheet = book.WorkSheets.Item(1) 'とりあえず1番目のシートを取得
'変数「sheet」に対して処理など・・・・
book.Saveas("保存先パス") '.DisplayAlertsがfalseであれば同名ファイルは上書きされる。
.Quit() ' Excel.Applicationを破棄
end with
■さいごに
おそらくCOMオブジェクト?を呼びしだしてそのオブジェクトの操作をしているだけなのでVBSで、というよりかは、COMオブジェクトを用いて、エクセルを開いて、編集、名前を付けて保存という表現が正しい気がします。