追記：本件Docker For MacのVirtioFSに依存したバグのようです。

Docker For Macで自動テストが落ちる

SQLSTATE[HY000]: General error: 1030 Got error -1 from storage engineで落ちる。
phpunitが落ちたり落ちなかったり不安定.
エラー的にはMySQLの問題の様子。

サーバの容量不足でエラー（HY000、1030、Got error 28）
的な記事はたくさん見つかるが-1ってなんや...
とMySQLの記事を読み漁る。

同じエラーの記事を見つける

my.cnfのinnodb_force_recoveryを0にすると治った！！という記事を見つけるも私の事象とは異なった。

悩んだ末に

落ちたり落ちなかったりするし負荷的な問題では？と思い色々試してみる

解決!!!

Docker For DesktopのPreferencesを開き
ResourcesからCPUsを調整する(筆者はCPUsを1にした)

再起動して実行するとほぼ落ちなくなりました。

あとがき

Docker側のリソースを小さくするとCIにかかる時間は伸びましたが許容範囲ではあります。
ブラウザの遷移も気持ち遅くなった気はするが耐えられるレベル

テスト実行中にブラウザのリロードを連打するとテストが落ちるので、
まぁ負荷的な問題でMySQLのコンテナが耐えられないので間違いなさそう。
MySQLのコンテナをスケールアップすることで改善できる可能性があるが
ストレス無い感じで動作していて
かつ共同開発環境のためコンテナの設定をすぐに弄れなさそうなので一旦解決とする。
チームの方は発生していなくてM1のMacを使っているのは少数派みたいなので、ひょっとするとホストOSのCPUが影響している可能性もなきにしもあらずかも。
(amd64のイメージを動かしているため警告がてている状態)

(余談ですがnable VirtioFS accelerated directory sharingを有効にするとだいぶ速度改善した気がします。M1 Air)