Node.jsのORMであるSequelizeで、Group byを使ったCOUNT関数やSUM関数をどう書けばよいかを調べてみました（MySQLを使っている場合）。
例えば、以下の様なテーブルがあったとして、

Chargeテーブル

var Charge = sequelize.define('Charge', {
  userId: { Sequelize.INTEGER },
  companyId: { Sequelize.INTEGER },
  amount: { Sequelize.INTEGER }
});

SQL

SELECT companyId, SUM(amount) AS 'totalAmount'
FROM Charge
GROUP BY companyId;

みたいな感じでamountフィールドをcompanyId毎に集計したい場合は、

Sequelize

Charge.findAll({
  attributes: [
    'companyId',
    [sequelize.fn('sum', sequelize.col('amount')), 'totalAmount']
  ],
  group: ["companyId"]
}).then(function (results) {
  results.forEach(function(result){
    
  });
}).error(function(err){

});

と書くことができます。

[sequelize.fn('sum', sequelize.col('amount')), 'totalAmount']]
のsumの部分には、avg、count、min、maxなど、関数が使えそうです（すべての関数を試したわけじゃないです）。もちろん、関数は使用しているデータベースに依存すると思われます。

注意点

集計結果を取得するときに、例えば上記の例だと、totalAmountという別名を付けているので、result.totalAmountと書きたいところですが、これだとなぜかundefinedになってしまいます。
仕方ないので、result.dataValues['totalAmount']として値を参照しています。これはSequelizeのバージョン（テストに使ったSequelizeのバージョンは、1.7.9）に依存するバグなのかも知れません。