ようやくMacの内蔵ハードディスクの暗号解除が、完了しました。
そして、外付けのハードディスクから起動に成功しました。

##今回分かったこと
ハードディスクを暗号化している状態では、コピーできても起動できない。
APFSは、容量の変更ができない。
ディスクユーティリティでは、APSFのパーテーションを指定して、復元を行うことができない。

##今回の手順
こちらの記事の中にあるコマンドの例を使い、Recovery HDのパーテーションを作ります。
http://blog.niw.at/post/38869084107

ディスクユーティリティを使い、今作ったパーテーションを指定して内蔵HDDのRecovery HDを復元します。
再起動します。
command＋Rで、macOSのユーティリティを起動します。
メニューの一番下のディスクユーティリティを選択して起動します。
外付けHDDの空きパーテーションを指定して、内蔵HDDのコンテナDiskを復元します。

##これで完了
オプションキーを押しながら再起動して、起動ディスクを選択します。
そして、USBのアイコンのMacintosh HDを指定して起動すると立ち上がります。

USB３.０であれば、違和感も感じないと思います。
私も、新しい環境で、この記事を書いていますが問題ないです。

APSFでパーテーションを作るときは、複数別のフォーマットでパーテーションを作っておきましょう。
そうしないと、Recovery HD以外の空きスペースが、全部APFSになってしまい容量の変更ができな苦なり困ることになります。