最初ctagsを導入して、vimプラグインを使用して自動更新する方法を調べていたら、
gitから自動で更新する記事を目にして、こちらの方も調べて導入する時に Linuxやmacの書き方はいくつも見つかったが、
Windowsの書き方がいまいち分からなかった。
調べていくうちに、Pythonで書くことが出来るのが判って、希望どうりの動きをしてくれている物を書くことが出来た。

Git Hooks (Part II) – Implementing Git hooks using Python — Omer Katz — A Blog about Software Development, DevOps, Source Control, SCM, ALM & other related topics.

前提

windows
git
python
インストールしてコマンドラインからも呼び出せるようになっていること

hooksファイルを作成

そもそも、hooks/ は $ git init したら .git/ 内に作成される。
git で merge, pull, commit, checkoutなどが実行されたら、
記載されている動作を実行するようになる。

しかし、$ git init するたびに hooks/ 内のファイルを書き換えるのは面倒なので、
テンプレートを作成して、$ gint init したらテンプレートをコピーしてくれるように設定する。

新しくフォルダを .git_tmp/hooks/などと作成
hooks/内に、post-merge, post-commit, post-checknutを作成
post-*すべてのファイル内容を下記のコードにする

# !/usr/bin/env python

import os
import subprocess

tags = '.git/tags'

if os.path.exists(tags):
os.remove(tags)

cmd = 'ctags -R --sort=yes --append=no -f ' + tags + ' %CD%'
returncode = subprocess.Popen(cmd, shell=True)

動作は.git/tagsファイルが存在していれば削除して新しくctagsで.git内にtagsファイルを作成する。

$ git init するたびに hooks の内容を .git_tmp/hooks/ の中身で作成されるようにする。
コマンドラインなどで $ git config --global init.templatedir .git_tmpを実行

これで、git init したら、 .git_tmp/hooks/ の内容で .git/hooks/ が作成される。

参考

gitのhookでtags作成 - Qiita
ctagsと連携するように環境を構築する - Qiita
GitHub - AdaCore/git-hooks: Git hooks Python-based scripts
Pythonからコマンドを呼び出す（Windows編） - Qiita

トラブル

.git_tmpがコピーされない。
.gitconfigを直接開いて、templatedir = ‘./.git_tmp‘ から templatedir = .//.git_tmpに変更したらうまくコピーした。
tagsファイルが読み込まれない。（Error: E429: File "project/.git/lib\util.php" does not exist)
vim-fugitive でおかしくなっている？
tagsファイルをそのまま.gitから出して、projectフォルダに移動させたら正常に動いた。
tagsファイル内のパスがおかしいのか？ lib\util.php ではなく ..\lib\util.php だと動作した。
つまりは、 project/.git/lib の /.git/ 部分が余計なのかな？
解決：フルパスで作成するようにしたら、問題なく動いた。ソースコードを更新