概要

CWLのワークフロー(class: Workflow)の、steps において、１つの入力ファイルをうけるようなツールに、
複数のファイルを渡したいときの書き方。

inに複数ファイルをうけるようにかいて
scatter 入力で複数ファイルのパラメータを指定する。
以下の例では
download_fastq は、複数のファイルを出力する可能性がある(fastq_files)
一方 gunzip は、ツール定義(class: Workflow)としては、１つの入力しか受けつけない。
それを複数受けられるようにするために、scatter を使い、file を１つづつ、gunzipにわたす。

steps:
  download_fastq:
    run: download-fastq.cwl
    in:
      run_ids: run_ids
    out:
      [fastq_files]
  gunzip:
    run: gunzip.cwl
    in:
      file: download_fastq/fastq_files
    scatter: file
    out:
      [decompressed]