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Redshift Spectrumの実装フロー

Last updated at Posted at 2019-04-16

RedshiftSpectrumとは、
S3に保存したテキストファイルやParquetなどのカラムナフォーマットを
Redsihft上で直接読込処理できるサービス。
容量無限大のS3をデータレイクとして利用できるようになり、
Redshiftのストレージに拡張性が加わった。
ようは、今までよりお安く大容量化できますよ!ということ。

image.png

Spectrumへの置換手順

具体的にどのような手順で置換作業を進めればよいのか。
Spectrumのサービス開始から日が浅いため
ネット情報もあまりなく、Redshiftのドキュメントが頼り。。。
結構な回り道と試行錯誤があったが、
最終的にはSpectrum置換フレームワークを得られたと思う。

事前準備

  • GlueもしくはAthenaのサービスを利用可能にしておく
    ※本件はGlueの場合を解説しています
  • Parquetを作成する手段を決めておく
    ※EMRか、GlueのETLか、PySparkか、PyArrowか…
    PyArrowでテキストファイルからParquetファイルを作成する方法 にて詳細記述
  • Parquetの圧縮形式を決めておく
    ※gzipか、snappyか、非圧縮か
  • 外部テーブルのパーティション名を決めておく(テーブル列名と重複禁止)
  • Create External Schema文で外部テーブルと外部スキーマを作成しておく
外部スキーマの作成.sql
CREATE EXTERNAL SCHEMA spectrum_schema_test 
  FROM
    DATA CATALOG --DATA CATALOGと指定 
    DATABASE 'spectrum_db' --作成したい外部データベース名
    IAM_ROLE 'arn:aws:iam::xxxxxx/xxxx-anars,arn:aws:iam::yyy/yyyyy-redshift' --※
    CATALOG_ROLE 'arn:aws:iam::xxxxx/xxxxx-anars' --データカタログのアクセス許可に使用するIAM_ROLEを指定
    CREATE EXTERNAL DATABASE IF NOT EXISTS  
;

/*
※
ここでは、S3とGlueカタログ所有者が違う場合のIAM_ROLEの指定方法を記述。
アカウントyyyの管理するS3バケットに、アカウントxxxがSpectrumでデータを参照しに行く許可を得ている
*/

置換対象のテーブルを決める

Redshift内にあるテーブルのメンテナンスパターンは、大きく3パターン。
一番シンプルなのは、レコード追加のみのテーブル。
これは単純に置換が可能。
ただ、テーブル総入替とレコード更新のパターンは場合によっては
置換ができないケースもあると思われる。

パターン テーブル
更新形式
適用容易さ 理由
レコード追加   INSERT
or
COPY
一番シンプル
テーブル総入替 TRUNCATE
&
COPY
入替行数多→恩恵無し
入替行数少→検討余地あり
レコード更新 UPDATE
&
INSERT
× 変更発生個所のみ
カラムナフォーマットの更新が必要

Spectrum化によるデータ確保量を見積もる

  • 置換対象テーブルのデータ量を算出
  • まずは小さいテーブルで検証
  • 検証後、容量の大きいテーブルから進める

実装フロー

RedshiftSpectrumの導入に当たっては、次のフローで
進めるのがよさげです。

1. Spectrumに置換したいテーブルの定義書を確認

  • CHAR列やVARCHAR列について、CR(CHR(10))とLF(CHR(13))が含まれていないか確認。
    含まれている場合は、空文字に置換する

2. 区切りたいパーティション毎にRedshiftからS3へUNLOADする

  • たとえば日付でパーティション区切りたい場合、日付ごとにUNLOADを実行
  • 出力先は、s3://spectrum/org/2015-01-01/000.gz など…。
    ※ディレクトリを都度切るかはこの後の実装処理次第

3. UNLOADしたファイルをPySparkやPyArrowでParquet形式に変換

  • 変換後、Spectrum参照用のディレクトリへ配置する。
    ※ローカルで処理する場合、変換対象ファイルをDL→Parquet変換→S3へUP
  • 日付でパーティション区切りの場合、次のようにディレクトリを切る。
    太字の部分でパーティションを表すが、この後作成する外部テーブルの列名と重複させないこと。
    • s3://spectrum/parquet/part_date=2015-01-01/000.parquet
    • s3://spectrum/parquet/part_date=2015-01-02/000.parquet
    • s3://spectrum/parquet/part_date=2015-01-03/000.parquet

4. 外部テーブルを作成、ALTER TABLE でパーティションを区切る

  • 構文は後述(◆)を参照
  • Glueの機能で区切ってもよい
  • パーティションを区切った数と、S3で作成したパーティション数が一致するか確認。
    テーブルのパーティション数はSELECT * FROM SVV_EXTERNAL_PARTITIONS;で確認可能。

5. 元のテーブルと外部テーブルを比較し、同一内容か確認する。

  • 違ってた場合、下記のポイントで検討をつける
    • UNLOAD時(例:改行の置換漏れ)
    • Parquet変換時(例:データ型相違、Sparkのタイムゾーンで変換時に時刻ずれ発生)
    • 外部テーブルからの読込時(例:データ型相違)

6. 遅延バインディングで外部テーブルの遅延VIEWを作成する

  • CREATE VIEW ビュー名 AS SELECT * FROM 外部スキーマ.外部テーブル WITH NO SCHEMA BINDING;
  • 遅延VIEWを作成しないと、BIツールやSQLクライアントで外部テーブルを認識できないケースあり

7. Spectrumとローカルのパフォーマンスを比較

  • WHEREとJOINの性能検証。結果次第では下記2パターン
    • Parquetの圧縮形式見直し検討(snappy、もしくは非圧縮)
    • パーティションの見直し検討
  • 性能検証で問題ないと判断後、ローカルのデータをDELETE
  • 適宜タイミングを見計らって日次バッチ処理等に移管

(◆)外部テーブル作成構文

◆外部テーブル作成構文.sql
/* ### Superユーザーじゃないと作成不可 ### */ 
CREATE EXTERNAL TABLE 外部スキーマ.テーブル名( 
  date_time date
  , id int
) 
PARTITIONED BY       ----- S3のディレクトリ構造でパーティション化する
    (part_date DATE) ----- パーティション名:part_date DATE型 
STORED AS parquet    ----- 元データ保存形式:parquet
LOCATION 's3://spectrum/parquet/' ----元データ保存ディレクトリorファイル 
;

--ALTER TABLE でテーブルにパーティションを認識させる
ALTER TABLE 外部スキーマ.外部テーブル 
 ADD PARTITION (part_date='2015-01-01') 
 LOCATION 's3://spectrum/parquet/part_date=2015-01-01/'
;

注意点

  • 外部テーブルの作成は、スーパーユーザーのみ可能
    • 一般ユーザーは参照のみ
  • 文字列置換について
    • 改行コード(CR,LF)はParquet変換時にエラーになるため、置換を忘れずに
    • Parquet形式変換時、空文字はNULLに置換される
  • 遅延バインディングについて
    • ビューコメントは可能
    • ただし、カラムコメントは付与できない
      ※VIEWの対象に実テーブルを挟んでもダメ

補足

【Parquet形式を選んだ理由】

  1. Parquet形式のほうがドキュメント多く、学習コストが低かった
  2. 検証段階でORC形式への変換が上手くいかなかった

【外部テーブルについて】

  • ALTER TABLE でパーティションを切ると、外部テーブルにパーティション列が追加される(下図参照)
  • あくまでも列の1つなので、SELECT パーティション列名 FROM 外部テーブル;でデータ抽出も可能
  • 追加されたパーティション列は、遅延ビュー化すると列名候補にあがってくる(SQLクライアントに依存)

image.png

参考

Amazon Redshift Spectrum の開始方法

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