エディタのほうのAtomのお話です。
AtomのInit FileをClojureScriptで書きたいなと思って調べたらできたのでメモします。

まずは、ホームディレクトリ/.atom に移動してnpm install clojurescriptを実行することで
clojurescript-npm をローカルインストールします。
（ホームディレクトリ/.atom/node_modules/clojurescript ができればOK）
そうすることでinit.coffeeの中でrequire 'clojurescript'ができるようになります。

次にinit.coffeeに以下の記述をします。

init.coffee

os = require 'os'
path = require 'path'
fs = require 'fs'
cljs = require 'clojurescript'
cljs.context.atom = atom
cljs.context.protoRepl = protoRepl

initCljs = path.join os.homedir(), '.atom/init.cljs'
fs.readFile initCljs, 'utf8', (err, data) ->
  throw err if err
  cljs.eval("(do #{data})")

これで準備が整いました。あとはホームディレクトリ/.atom/init.cljsファイルを作ってClojureScriptで設定を記述できます。
例えば以下のように

init.cljs

(.log js/console global.atom)
(.log js/console global.atom.commands)
(.. global.atom.commands
    (add "atom-text-editor" "cljs:sample-linefirst"
         #(.. global.atom.workspace
              getActiveTextEditor
              getLastCursor
              moveToFirstCharacterOfLine)))

これで、Proto REPLパッケージのSelf Hosted ClojureScript REPLを使ってAtom自身の操作を試しつつ、その結果をinit.cljsに反映できてハッピーになれそうです。

init.coffeeの中身の解説を少しすると
cljs.context.XXXに代入するとinit.cljsのほうではglobal.XXXで参照できます。
cljs.evalの引数は単一のフォームでないとエラーになるのでdoで囲っています。
ここでは使ってませんが、cljs.newContext()を使うとadm-zipがないと怒られてなぜかダメでした。