こんにちは。
二つの CSV ファイル内の値の差を調べるために、git diff を用いてみました。色付き出力を指定しています。

$ git --no-pager diff --color --word-diff-regex="[^,]+" 1.csv 2.csv
diff --git a/1.csv b/2.csv
index a84bde8..9a2c7e4 100644
--- a/1.csv
+++ b/2.csv
@@ -1 +1 @@
1,2,[-3.4,5-]{+3.5,6+},7
$
$ cat 1.csv 2.csv
1,2,3.4,5,7
1,2,3.5,6,7
$

また上記の色付き出力を html ファイル化しました（aha コマンド利用）。

$ git --no-pager diff --color --word-diff-regex="[^,]+" 1.csv 2.csv | aha --title 1_vs_2 > 1_vs_2.html