コード

const priority = ['dog', 'cat', 'human']

const target = [
    {id:'caw'},
    {id:'pig'},
    {id:'dog'},
    {id:'car'},
    {id:'cat'},
    {id:'bird'},
    {id:'human'},
]

console.log(target2.filter( a => { 
    if (priority.includes(a.id)) {
        a.isSorted = true
        return true
    }
     }).concat(target2.filter( b => !priority.includes(b.id))))

[
  {
    "id": "dog",
    "isSorted": true
  },
  {
    "id": "cat",
    "isSorted": true
  },
  {
    "id": "human",
    "isSorted": true
  },
  {
    "id": "caw"
  },
  {
    "id": "pig"
  },
  {
    "id": "car"
  },
  {
    "id": "bird"
  }
]

たまたまオブジェクト対象だったのでboolを生やすことにしましたが、filter中のこのような変更が可能だったのかが多少不明瞭でした。

filterのMDNでは

filter() は呼び出された配列を変化させません。

filter() によって処理される配列要素の範囲は、callback が最初に呼び出される前に設定されます。filter() の呼び出しが開始された後に追加された配列要素に対しては、callback は実行されません。既存の配列要素が変更または削除された場合、callback に渡される値は filter() がそれらを参照した時点での値になります。削除された配列要素を参照することはありません。

とありますが、感覚的にはconst arrayなイメージですね。
内部の値への干渉はできるのですが、

Array.prototype.filter() - JavaScript | MDN#初期の配列への影響 (変更、追加、削除)

地味にcallback(element)を変更するサンプルがなかったので残しておきます。