Githubにプッシュしたディレクトリやファイルが非活性化していて開けないときの対処法

git pushはローカルリポジトリ内のコミットをリモートリポジトリに転送するものです。
なのでgithubにファイルが転送されていないのであれば、ローカルリポジトリにコミットされていないということです。

ローカルリポジトリの内容を確認してみてください。

リポジトリで管理しているファイルを一覧表示する

$ git ls-files

gitの管理対象外になっているファイルを一覧表示する

$ git status ignored

##.gitignoreファイルを確かめる。
中身を見て対象ファイルが除外ファイルに指定されていないか。
.gitignoreファイルの再生成は下記リンクを参考にする。

##.gitをリセットすればうまくいくかも

表示フォルダと非表示フォルダを一覧表示する。

ls -la

たとえば、出力は次のようになります。

total 24
drwxr-xr-x  4 mario mario  4096 Nov 21 00:02 .
drwxrwxrwt 24 root    root    12288 Nov 21 00:02 ..
drwxr-xr-x  2 mario mario  4096 Nov 21 00:02 frontend
drwxr-xr-x  7 mario mario  4096 Nov 21 00:02 .git

ここで、最後の行に、.git という名前のフォルダーが表示されています。次のコマンドを使用してフォルダーを削除する必要があります。

rm -fr .git

次に、git init コマンドを使用してフォルダーを再初期化できます。