チーム開発では、フォーク元から新しくブランチを切って開発すると思います。
その際、フォーク元のリポジトリが常に最新とは限りませんし、フォーク元のリポジトリからブランチを切ることが不都合なこともあると思います。
これは自分の場合だけかもしれませんが、
Githubデスクトップだけでは、フォーク元のリポジトリからしかブランチを切れませんでした。
そこで、コマンドで
$ git checkout -b 新しいブランチ名
これでフォーク元からではなく、自分のリポジトリ（master）から新しくブランチを作る事ができます。