はじめに
Bundler 2.1ではBundler 3で使えなくなる機能に対して警告が表示されるようになりました。
参考：【翻訳】Bundler 3アップグレードガイド - Qiita
この関係でBundler 2.1ではbundle installに--pathオプションを付けると以下のような警告が発生します。
$ bundle install --path vendor/bundle
[DEPRECATED] The `--path` flag is deprecated because it relies on being remembered across bundler invocations, which bundler will no longer do in future versions. Instead please use `bundle config set path 'vendor/bundle'`, and stop using this flag
この記事ではこの警告に対する対応手順を説明します。
なお、「今日初めてBundlerを使った」というRuby初心者さんは、必ずこの記事を最後まで読んでください！（大事な話が書いてあります）
対応手順
すでにbundle installを実行した場合
警告は出るものの、bundle install実行後も--path vendor/bundleのオプションは記憶されます。
ですので、それ以上の操作は必要ありません。
bundle installをまだ実行していない場合
bundle installをまだ実行していない場合は、bundle installを実行する前にbundle configコマンドで明示的にpathを設定してください。
それから--pathオプションなしでbundle installを実行すると警告は発生しません。
なお、pathの設定方法はglobalとlocalの2種類があります。
従来のbundle install --path vendor/bundleと同じ動きになるのはlocalの方です。
# マシン全体でbundle install実行時のインストール先を
# vendor/bundleに設定する場合（global）
bundle config set path 'vendor/bundle'
# そのプロジェクト内でのみ、bundle install実行時の
# インストール先をvendor/bundleに設定する場合（local）
bundle config set --local path 'vendor/bundle'
# --pathオプションなしでインストールを実行する
bundle install
最後に：でもちょっと待って！！本当にpathの指定は必要？
もしあなたが今までBundlerを使ったことがなく、「ネットで見つけたBundlerの紹介記事を見ながらbundle installをしようとしたら警告が出たので、警告メッセージでググってこのページにやってきた」という人であれば、きっと--path vendor/bundleを付ける必要はありません。
--path vendor/bundleのオプションを付けることを推奨している多くのWeb記事は、その必要性を十分に理解していないものが多いです。
pathオプションは特殊な条件下でしか必要になりません。
ですので、「今日初めてBundlerを使います」というような初心者さんは、 pathを指定せずにシンプルにbundle installを実行してください。
（すでにbundle install --path vendor/bundleを実行した人は、次回からpathオプションなしでbundle installしてください）
この件に関する詳しい話は以下の記事にまとめているので、こちらも読んでもらえると幸いです。
bundle install時に--path vendor/bundleを付ける必要性は本当にあるのか、もう一度よく考えてみよう - Qiita