マイグレーションを行う際以下のコマンドを使用するが

python3 manage.py makemigrations

このコマンドを使用すると失敗する

hoge@:huga/project$ python3 manage.py makemigrations
No changes detected

一番親のプロジェクトにあるsettings.pyに子のプロジェクトを追加したことを知らせていない事が原因でした。

settings.py

INSTALLED_APPS = [
  'django.contrib.admin',
  'マイグレーションフォルダがある作成したプロジェクト名を追加'
]

上記追加することで無事にinitial.pyが作成されました。
初歩的な事で、調べても中々出てきませんでした。
エラー内容も表示されないのでわかりにくかったですね。