###MMDモデルをUnity上で使う
には具体的に
http://tsubakit1.hateblo.jp/entry/2014/09/27/235941
や
https://qiita.com/hiroyuki_hon/items/931c79164b0ffe19517f
などを参考にしてください。

そこで
http://stereoarts.jp/
上記のサイトからMMD4Mecanimってのを使うと思うんですが、
手順通りに進んでいくと、prosessボタンおして3dモデルがつくられる！
ってとこで詰まります。
processed pmx2fbx
ってコンソール上にでるんですけど謎のコードがたくさん書いてあるファイルが出力され特にfbxのモデルは出力されません。

MMD4Mecanim/Editorの中にunity4,unity5というフォルダがあって
どうやら現時点(2017/12/16現在)ではUnity2017は対応してないっぽいです。

Unityのバージョンを下げると動くっぽいのでもし詰まっている人いたら試してください。