#0_始めに
研究室でPythonを使うことになったので生物系に必要そうなパッケージをインストールしようと思った
調べてみるとデータ分析系のパッケージは大体Anacondaにあるらしいのでそれを入れることにした
また,FASTAファイルを読み込みたかったのでBiopythonを入れた。
使用した環境は下に
OS:Widows 10 Home
Anaconda3: 5.0.0
#1_Anacondaをインストールする
まず,Windows向けのインストーラを以下からダウンロードした
自分はPython3.6versionの64bit版をダウンロードした。
https://www.anaconda.com/download/
ダウンロード後,インストーラーを起動し,インストールを完了させる。
この時,インストール先の場所を記録しておくといい（はず）
以下のサイトを参考にするといいと思います
http://pythondatascience.plavox.info/python%E3%81%AE%E3%82%A4%E3%83%B3%E3%82%B9%E3%83%88%E3%83%BC%E3%83%AB/python%E3%81%AE%E3%82%A4%E3%83%B3%E3%82%B9%E3%83%88%E3%83%BC%E3%83%AB-windows
#2 Pythonのパスを通す
コマンドプロンプトを開き,pythonの実行を確認してみる
こんな感じで表示されればOK,
|Anaconda ,Inc|の文字がない場合PythonとAnacondaのパスが通っていないので,以下を参考にパスを通す.自分の場合C:\ProgramData\Anaconda3
#3_biopythonをインストールする
Anacondaのなかにbiopythonは入っていないみたいなので追加したい。
プロキシ存在下の場合は,.condarcファイルを作成し,プロキシを設定する必要がある(学内回線なら必須）。
また,学内回線につなぐ際にidとpasswordが必要な場合,
http://ユーザID:パスワード@プロキシアドレス:ポート番号
というように記述する必要がある
https://qiita.com/mishan88/items/2f9e1c5e9e2572ba8a36 を参考にするとよい。
その後CortanaなどでAnacondaNavigatorを検索し,管理者権限で起動
（管理者権限で起動しないと書き込みができないのでエラーになる。）
起動後,Enviromentを選択,installedをNotinstalledに変更し検索欄にbiopythonを入力,
パッケージにチェックを入れると右下にApplyが出現するので実行。
#4_エディタについて
Pythonを実行するエディタについてだが,
anacondaをインストールした際についてくるjupyternotebookでもよさそう
AnacondaNavigatorから起動できる