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TensorFlow 2.0のDockerコンテナをGPU+Python3+Jupyterで使う

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先日、TensorFlow 2.0が正式にリリースされました。
この記事では、GPUサポートを有効にしたTensorFlow 2.0のDockerコンテナでJupyterを起動し、チュートリアルを動かすまでの手順を紹介します。

主な手順:

  1. Dockerのインストール
  2. NVIDIAドライバのインストール
  3. NVIDIA Container Toolkitのインストール
  4. TensorFlowコンテナの起動
  5. Jupyterにアクセス
  6. チュートリアルで動作確認

主な環境:

  • OS: Ubuntu 18.04.3 LTS
  • GPU: GeForce GTX 1050 Ti

やり方

Dockerのインストール

NVIDIA Container ToolkitがDocker 19.03を求めているので、バージョンが古い場合はアップデートしてください。
新規インストールする場合は次のコマンドを実行します。

$ sudo apt-get update
$ sudo apt-get install \
    apt-transport-https \
    ca-certificates \
    curl \
    gnupg-agent \
    software-properties-common
$ curl -fsSL https://download.docker.com/linux/ubuntu/gpg | sudo apt-key add -
$ sudo apt-key fingerprint 0EBFCD88
$ sudo add-apt-repository \
   "deb [arch=amd64] https://download.docker.com/linux/ubuntu \
   $(lsb_release -cs) \
   stable"
$ sudo apt-get update
$ sudo apt-get install docker-ce docker-ce-cli containerd.io

参考:

NVIDIAドライバのインストール

次のコマンドを実行します。

$ sudo ubuntu-drivers autoinstall

インストール後、再起動します。

$ sudo reboot

NVIDIA Container Toolkitのインストール

次のコマンドを実行します。

# Add the package repositories
$ distribution=$(. /etc/os-release;echo $ID$VERSION_ID)
$ curl -s -L https://nvidia.github.io/nvidia-docker/gpgkey | sudo apt-key add -
$ curl -s -L https://nvidia.github.io/nvidia-docker/$distribution/nvidia-docker.list | sudo tee /etc/apt/sources.list.d/nvidia-docker.list

$ sudo apt-get update && sudo apt-get install -y nvidia-container-toolkit
$ sudo systemctl restart docker

参考:

TensorFlow Dockerコンテナの起動

次のコマンドでイメージのプルとコンテナの起動を同時に行います。

$ sudo docker run --gpus all -u $(id -u):$(id -g) -d -p 8888:8888 -v ~/workspace:/tf tensorflow/tensorflow:latest-gpu-py3-jupyter

プルするイメージはtensorflow/tensorflow:latest-gpu-py3-jupyterです。
いろいろ試しましたがタグはこの順番でないとダメです。
またpy3を除いてもコンテナは起動できますが、Python 2になってしまうので除かないでください。(TensorFlow 2.0はPython 2では動かないはずですが…)

オプションの説明:

  • --gpus all: すべてのGPUを使う
  • -u $(id -u):$(id -g): 現在のユーザで起動する
  • -d: detachedモードで起動する
  • -p 8888:8888: Jupyterのポートを公開する
  • -v ~/workspace:/tf: ホストのボリュームをマウントする

参考:

Jupyterにアクセス

JupyterにアクセスするにはJupyter起動時に表示されるURLが必要ですが、コンテナをdetachedモードで起動したため、標準出力が表示されませんでした。
そこでコンテナのログを表示します。

次のコマンドでコンテナIDを取得します。(標準出力の一番左)

$ sudo docker ps
CONTAINER ID        IMAGE                                          COMMAND                  CREATED             STATUS              PORTS                    NAMES
989625a7fc2c        tensorflow/tensorflow:latest-gpu-py3-jupyter   "bash -c 'source /et…"   12 minutes ago      Up 12 minutes       0.0.0.0:8888->8888/tcp   pedantic_banzai

取得したコンテナIDを使って、次のコマンドでコンテナのログを表示し、JupyterのURLを取得します。

$ sudo docker logs 989625a7fc2c

________                               _______________
___  __/__________________________________  ____/__  /________      __
__  /  _  _ \_  __ \_  ___/  __ \_  ___/_  /_   __  /_  __ \_ | /| / /
_  /   /  __/  / / /(__  )/ /_/ /  /   _  __/   _  / / /_/ /_ |/ |/ /
/_/    \___//_/ /_//____/ \____//_/    /_/      /_/  \____/____/|__/


You are running this container as user with ID 1000 and group 1000,
which should map to the ID and group for your user on the Docker host. Great!

[I 08:59:18.372 NotebookApp] Writing notebook server cookie secret to /.local/share/jupyter/runtime/notebook_cookie_secret
/usr/local/lib/python3.6/dist-packages/IPython/paths.py:68: UserWarning: IPython parent '/' is not a writable location, using a temp directory.
  " using a temp directory.".format(parent))
[I 08:59:19.467 NotebookApp] Serving notebooks from local directory: /tf
[I 08:59:19.467 NotebookApp] The Jupyter Notebook is running at:
[I 08:59:19.467 NotebookApp] http://989625a7fc2c:8888/?token=c4a0d0593ce61b28570b5719ddad9a3759cf8623306c1e08
[I 08:59:19.467 NotebookApp]  or http://127.0.0.1:8888/?token=c4a0d0593ce61b28570b5719ddad9a3759cf8623306c1e08
[I 08:59:19.467 NotebookApp] Use Control-C to stop this server and shut down all kernels (twice to skip confirmation).
[C 08:59:19.485 NotebookApp]

    To access the notebook, open this file in a browser:
        file:///.local/share/jupyter/runtime/nbserver-1-open.html
    Or copy and paste one of these URLs:
        http://989625a7fc2c:8888/?token=c4a0d0593ce61b28570b5719ddad9a3759cf8623306c1e08
     or http://127.0.0.1:8888/?token=c4a0d0593ce61b28570b5719ddad9a3759cf8623306c1e08

ログにあるとおり、http://127.0.0.1:8888/?token=c4a0d0593ce61b28570b5719ddad9a3759cf8623306c1e08を使ってJupyterにアクセスします。

チュートリアルで動作確認

TensorFlow 2 quickstart for beginnersからチュートリアル用のNotebookをダウンロードします。

image.png

ダウンロードしたNotebookを実行します。

image.png

5セル目の実行中にGPUの使用状況を見てみます。

image.png

$ nvidia-smi
Tue Oct 29 19:16:43 2019       
+-----------------------------------------------------------------------------+
| NVIDIA-SMI 430.26       Driver Version: 430.26       CUDA Version: 10.2     |
|-------------------------------+----------------------+----------------------+
| GPU  Name        Persistence-M| Bus-Id        Disp.A | Volatile Uncorr. ECC |
| Fan  Temp  Perf  Pwr:Usage/Cap|         Memory-Usage | GPU-Util  Compute M. |
|===============================+======================+======================|
|   0  GeForce GTX 105...  Off  | 00000000:01:00.0 Off |                  N/A |
| 43%   31C    P0    N/A /  75W |   3867MiB /  4038MiB |     10%      Default |
+-------------------------------+----------------------+----------------------+
|   1  GeForce GTX 105...  Off  | 00000000:02:00.0 Off |                  N/A |
| 43%   32C    P0    N/A /  75W |     57MiB /  4040MiB |      0%      Default |
+-------------------------------+----------------------+----------------------+

+-----------------------------------------------------------------------------+
| Processes:                                                       GPU Memory |
|  GPU       PID   Type   Process name                             Usage      |
|=============================================================================|
|    0      1387      G   /usr/lib/xorg/Xorg                            13MiB |
|    0      4252      C   /usr/bin/python3                            3841MiB |
|    1      4252      C   /usr/bin/python3                              45MiB |
+-----------------------------------------------------------------------------+

ちゃんとGPUを使ってくれました。

終わり

ちょうど今日からKaggleでTensorFlow 2.0 Question Answeringというコンペが始まりました。
TensorFlow 2.0を使ってくれた誰かにTensorFlow 2.0賞(総額$25,000)が贈られるそうです。
これを機に私も勉強してみようと思います。

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