を調整してユーザーアイコン用のアップローダーを作りました。

ファイル選択時に以下の動作をするように変更したものになります。

画像の中心を変更せずに短辺に合わせて正方形にトリミングしてリサイズする。

送信ボタンをつけてますが、ファイル選択時に送信を実行するように調整したら良いと思います。

<!DOCTYPE html>
<html>
<head>
<script>
var canvas = null;
var context = null;
var image = null;
var fixFileObject = null;
var iconWidth = 80;
var iconHeight = 80;
var messageArea = null;

document.addEventListener("DOMContentLoaded", function() {
    canvas = document.getElementById("thumbnail");
    context = canvas.getContext("2d");

    messageArea = document.getElementById("message")

    setFileEventListenner();
});

function setFileEventListenner() {
    document.getElementById("file-selecter").addEventListener("change", createPreview);
}

function createPreview(event) {

    fixFileObject = null;

    var fileObject = event.target.files[0];

    if (typeof fileObject === "undefined") {
        return;
    }

    if (fileObject.type.match(/^image\/(jpeg|png)$/) === null) {
        // jpegとpng以外の場合はクリアして終了
        var fileArea = document.getElementById("file-input");
        fileArea.innerHTML = fileArea.innerHTML;
        setFileEventListenner();
        return;
    }

    fixFileObject = fileObject;

    image = new Image();

    var reader = new FileReader();

    reader.onload = (function(fileObject) {
        return function(event) {
            image.src = event.target.result;// base64
        };
    })(fileObject);

    image.onload = function() {
        drawCanvas();
    }

    reader.readAsDataURL(fileObject);
}

function drawCanvas() {
    if (image !== null) {
        var shortLength = image.width < image.height ? image.width : image.height;
        var widthCutLength = image.width - shortLength;
        var heightCutLength = image.height - shortLength;

        canvas.width = iconWidth;
        canvas.height = iconHeight;
        context.clearRect(0, 0, iconWidth, iconHeight);
        context.drawImage(image, widthCutLength / 2, heightCutLength / 2, shortLength, shortLength, 0, 0, iconWidth, iconHeight);
    }
}

function submitResizeFile() {
    if (image !== null && fixFileObject !== null) {

        var resizeFileObject = null;

        var image64Data = canvas.toDataURL(fixFileObject.type);
        image64Data = image64Data.split(',')[1];
        imageData = atob(image64Data);
        var unit8Array = new Uint8Array(imageData.length);
        unit8Array.forEach(function(element, index) {
            unit8Array[index] = imageData.charCodeAt(index);
        });
        resizeFileObject = new File(
            [unit8Array],
            fixFileObject.name,
            {
                type: fixFileObject.type
            }
        );

        var formData = new FormData();
        formData.append("file", resizeFileObject);

        // input type file の 値はjavascriptで上書き出来ないのでajaxで送信する
        var xhr = new XMLHttpRequest();
        xhr.onreadystatechange = function() {
            if (xhr.readyState === XMLHttpRequest.DONE) {
                if (xhr.status === 200) {
                    messageArea.innerHTML = '<span style="color: green;">ファイルの送信に成功しました。</span>';
                } else {
                    messageArea.innerHTML = '<span style="color: red;">ファイルの送信に失敗しました。</span>';
                }
            }
        }
        xhr.open("POST", "/root/execute_upload");
        xhr.send(formData);
    }
}
</script>
</head>
<body>
<form id="form">
    <div id="file-input"><input id="file-selecter" type="file" name="file" accept="image/jpeg, image/png"></div>
    <div><canvas id="thumbnail" width="10" height="10"></canvas></div>
    <input type="button" value="送信" onclick="submitResizeFile()">
    <div id="message"></div>
</form>
</body>
</html>

参考

CanvasRenderingContext2D.drawImage()

JavaScriptでユーザーアイコンのアップローダー

参考