apt-keyはapt用のGPG公開鍵を管理するコマンドです。3rd partyのリポジトリを追加するときなどに利用します。
ところで、誤って登録してしまった公開鍵を消すのに意外と苦労したので紹介します（apt-key listの出力が昔と変わっていて、古い情報がヒットしてしまった可能性がありそう）
消し方
登録済みの公開鍵を削除するコマンドは次の形式になります。
# apt-key del <keyid>
このkeyidというのは、finger printの最後の8文字のことです。
$ sudo apt-key list
/etc/apt/trusted.gpg
--------------------
...
pub rsa2048 2017-02-20 [SC]
9DD9 479D 06BA A713 2280 3AC1 6633 2B78 417E 73EA
uid [ unknown] Hatena Co., Ltd. <admin@mackerel.io>
...
上記の鍵は次のように削除できます。
$ sudo apt-key del 417E73EA
OK