Google App Engine(GAE)をアップデートすると設定がクリアされ、Runができなくなる場合があります。GAE Launcherを使用し、うまくいかない場合はまずLogを見るようにします。Logはメニュー[Control] > [Log Console]で見ることができます。
NameError: name 'execfile' is not defined
今回Log画面にはこのように表示され、Runができませんでした。どうやらPythonの実行ファイルが見つからないためのエラーのようです。実行ファイルの設定はメニューの[Edit] > [Preferences]を選択します。
Python Pathの欄にPythonの実行ファイルのパスを入力し、[OK]を押すと無事Runができるようになりました。